2007年5月起，中国科学院南京土壤研究所和公司合作组建了生态功能肥料研发中心，主要就新型有机无机复合肥、缓控释肥料进行共同攻关和产业化应用。

 在土壤所的技术支持下，公司进行了技术升级和工艺装置的改造。2007年，中东公司建成了年产30万吨磷酸一铵、年产30万吨氯基复合肥、年产30万吨硫基复合肥、硫酸余热发电生产装置各一套，完成了磷酸年产量新增30.2万吨的改扩建工程项目的建设，同时完成生产主厂房、仓库和其他配套设施等建设。在江苏总部，公司斥资1000多万元改造生产工艺，改为氨酸法造粒。2008年10月，年产60万吨复合肥项目竣工。

 针对活性物干粉与无机养分基质复合时原料配伍和造粒技术、原有复合肥生产工艺优化及设备调整等进行攻关，建成了年产10万吨的新型生态专用复合肥料生产线，先后开发了具有缓释增效功能的含活性物新型生态专用复合肥料产品5种，并进行肥效验证、配方优化，及适合当地的施肥模式示范推广。目前，在江苏靖江、宿迁、常熟和金坛地区进行了水稻、小麦专用肥的示范推广，均取得了良好的效果：水稻增产6.9－11.2%，小麦增产6.2－9.4%；而且在比无机肥对照养分用量减少10％以上的情况下仍然可以取得增产。

 此外，以土壤所为技术依托，公司获批2008年国家级星火计划（项目编号：2008GA690066）。

 目前正在申报江苏省工程技术研究中心。